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我國的水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)達程度位居世界之首，但是環(huán)境保護措施卻相對滯后。一些臨海城市的港灣眾多，淺海灘涂遼闊，海洋生物資源豐富。水產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展伴隨了大量的水產(chǎn)養(yǎng)殖廢水排放，使得水體污染嚴重，帶來了一系列的環(huán)保問題。

水產(chǎn)養(yǎng)殖廢水中主要的污染物有氨氮、亞硝酸鹽、有機污染物、磷及污損生物。目前，我國已開展了一些港灣及傳統(tǒng)網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)的污損生物調查研究。與工業(yè)、生活污水不同，水產(chǎn)魚污水屬污染物成分簡單的低濃度有機污水，BOD一般也較低。但水產(chǎn)生物對水質的要求較高。氨氮是水產(chǎn)生物的排泄物，也是殘餌、糞便以及動植物尸體等有機物分解的終產(chǎn)物。水質和底質敗壞會誘發(fā)弧菌等致病菌的大量繁殖，并且導致疾病發(fā)生，更多的是由于生態(tài)系統(tǒng)的破壞和放養(yǎng)密度的增加而導致生態(tài)失衡的綜合因素所致，水生物的抗病力降低，造成更易感染致病菌。

目前，養(yǎng)殖方式已由以前的粗養(yǎng)、半精養(yǎng)向精養(yǎng)過渡，但由于養(yǎng)殖密度過大，養(yǎng)殖水體中自然生態(tài)體系的平衡被打破，自身污染嚴重。另外，由于工業(yè)廢水、生活污水的亂排亂放，導致養(yǎng)殖水體的外源污染也日益嚴重，養(yǎng)殖病害頻繁發(fā)生養(yǎng)殖污染已成為繼工業(yè)污染、生活污染之后的第三大污染源，成為我國水源污染的主要原因之一。這些養(yǎng)殖場產(chǎn)生的污染如得不到及時的處理，必將產(chǎn)生對環(huán)境的極大危害，造成生態(tài)環(huán)境惡化、水產(chǎn)品品質下降并危及人體健康。