養殖廢水直接排入或隨雨水沖刷進入江河湖庫,大量消耗水體中的溶解氧,會使水體變黑發臭,造成水體污染。養殖場產生的糞污排放造成地表水、地下水、土壤和環境空氣的嚴重污染,直接影響了人們的身體健康,而未經處理的糞污中含有大量污染物質。
養殖污水長時間滲入地下,使地下水中的硝態氮或亞硝態氮濃度增高,地下水溶解氧含量減少,有毒成分增多,導致水質惡化,嚴重危及周邊生活用水的水質。高濃度污水還可導致土壤孔隙堵塞,造成土壤透氣、透水性下降及板結、鹽化,嚴重降低土壤質量,甚至傷害農作物,造成農作物生長受阻或死忘。
糞污水中含有大量的氮、磷等營養物是造成水體富營養化的重要原因之一,排入魚塘及河流使對有機物污染敏感的水生生物逐漸死亡, 嚴重者導致魚塘及河流喪失使用功能。
目前國家對環境污染整治力度的不斷增強,地方上也加強了養殖污水處理設施的建設,但往往因為運行費用過高而導致建成后就閑置不用,造成資源浪費環境污染問題卻仍得不到妥善解決。針對這些問題,綜合考慮養殖場的污染治理投資能力及地區區域特征,研究采用適合不同地區的經濟高效污水處理工藝。目前也有許多研究較為成功的厭氧處理、好氧處理以及天然凈化處理工藝。將污水處理工廠化和自然生物處理,好氧和厭氧處理進行有機組合以求達到最佳處理效果。